西北農(nóng)林科技大學(xué)姜雨教授團(tuán)隊與雷初朝教授團(tuán)隊合作在黃牛分類和遺傳適應(yīng)性研究領(lǐng)域取得進(jìn)展,相關(guān)研究成果以“全基因組重測序分類世界家牛血統(tǒng),并反映東亞家牛的三個血統(tǒng)來源和外緣物種基因的適應(yīng)性滲入(Whole-genome resequencing reveals world-wide ancestry and adaptive introgression events of domesticated cattle in East Asia)”為題,于2018年6月14日在《自然-通訊》在線發(fā)表。
該研究對我國22個代表性地方品種的111頭黃牛和8個陜西石峁遺址的4000年前的古代黃牛樣品進(jìn)行了全基因組重測序,同時下載比較了國外27個牛種的149個個體的全基因組數(shù)據(jù)。*證明全世界家牛至少可以分為五個明顯不同的類群,即為歐洲普通牛、歐亞普通牛、東亞普通牛、中國南方瘤牛和印度瘤牛,其五類父系祖先被對應(yīng)命名為Y1、Y2a、Y2b、Y3a與Y3b。中國黃牛地方品種來源于其中的三個血統(tǒng),分別為約4000年前就到達(dá)中國北方地區(qū),目前以純系僅在青藏高原和東北地區(qū)存在的東亞普通牛;可能在1000年前進(jìn)入中國北方,以蒙古牛和哈薩克牛為代表的歐亞普通牛;以及該論文新報道的與印度瘤牛早在四萬年前就分離,具體來源和傳播歷史仍然未知的中國南方瘤牛。
該論文還發(fā)現(xiàn)通過歷史上的跨物種人工雜交選育,中國南方瘤牛和青藏高原的普通牛平均每個個體分別被導(dǎo)入了其近緣物種爪哇野牛的2.9%和牦牛的1.2%的血統(tǒng),從而使得遷徙到中國南方和青藏高原的黃牛各自提高了對所在環(huán)境的適應(yīng)性。特別是外源爪哇野牛血統(tǒng)的導(dǎo)入,造成中國南方瘤牛的遺傳多樣性是印度瘤牛的兩倍,歐洲普通牛的四倍,成為中國黃牛高遺傳多樣性的主要貢獻(xiàn)源頭,是選育適應(yīng)中國南方濕熱氣候的肉牛和奶牛新品種的寶貴財富。論文對中國黃牛遺傳特性來源系統(tǒng)全面的分析將為我國兼顧高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)和抗逆的肉牛新品種培育提供理論基礎(chǔ)。該研究受到國家肉牛牦牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項、國家自然科學(xué)基金和青年千人計劃的資助,以及校高性能計算平臺的支持。
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